Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PCLAFQ15004 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PCLAFQ15004 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253 ms