Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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