Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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GPNMBQ14956 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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GPNMBQ14956 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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