Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.7□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RFTN1Q14699 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms