Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NCOA4Q13772 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
NCOA4Q13772 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NCOA4Q13772 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NCOA4Q13772 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NCOA4Q13772 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NCOA4Q13772 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NCOA4Q13772 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NCOA4Q13772 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NCOA4Q13772 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.2 ms