Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.62
ATRQ13535 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.62
ATRQ13535 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.62
ATRQ13535 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.62
ATRQ13535 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.62
ATRQ13535 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ATRQ13535 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ATRQ13535 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ATRQ13535 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ATRQ13535 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ATRQ13535 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ATRQ13535 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATRQ13535 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATRQ13535 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATRQ13535 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATRQ13535 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATRQ13535 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATRQ13535 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATRQ13535 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATRQ13535 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATRQ13535 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATRQ13535 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATRQ13535 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATRQ13535 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATRQ13535 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATRQ13535 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATRQ13535 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATRQ13535 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATRQ13535 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATRQ13535 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATRQ13535 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATRQ13535 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATRQ13535 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATRQ13535 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATRQ13535 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATRQ13535 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATRQ13535 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATRQ13535 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATRQ13535 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATRQ13535 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATRQ13535 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATRQ13535 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATRQ13535 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATRQ13535 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATRQ13535 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATRQ13535 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATRQ13535 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATRQ13535 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATRQ13535 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATRQ13535 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATRQ13535 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATRQ13535 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATRQ13535 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATRQ13535 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATRQ13535 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
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