Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1475 ms