Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SEMA3BQ13214 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SEMA3BQ13214 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SEMA3BQ13214 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SEMA3BQ13214 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SEMA3BQ13214 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SEMA3BQ13214 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SEMA3BQ13214 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SEMA3BQ13214 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SEMA3BQ13214 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SEMA3BQ13214 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEMA3BQ13214 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SEMA3BQ13214 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SEMA3BQ13214 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SEMA3BQ13214 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SEMA3BQ13214 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SEMA3BQ13214 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SEMA3BQ13214 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SEMA3BQ13214 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SEMA3BQ13214 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SEMA3BQ13214 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SEMA3BQ13214 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SEMA3BQ13214 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SEMA3BQ13214 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
SEMA3BQ13214 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SEMA3BQ13214 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SEMA3BQ13214 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SEMA3BQ13214 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SEMA3BQ13214 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SEMA3BQ13214 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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