Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRXP46100 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRXP46100 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRXP46100 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRXP46100 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRXP46100 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRXP46100 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRXP46100 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRXP46100 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRXP46100 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRXP46100 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRXP46100 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRXP46100 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATRXP46100 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATRXP46100 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATRXP46100 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ATRXP46100 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATRXP46100 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATRXP46100 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATRXP46100 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
ATRXP46100 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRXP46100 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRXP46100 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRXP46100 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRXP46100 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRXP46100 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRXP46100 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRXP46100 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRXP46100 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRXP46100 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRXP46100 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRXP46100 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRXP46100 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRXP46100 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRXP46100 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRXP46100 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRXP46100 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRXP46100 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRXP46100 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRXP46100 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRXP46100 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRXP46100 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRXP46100 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRXP46100 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRXP46100 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRXP46100 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRXP46100 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRXP46100 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRXP46100 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRXP46100 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRXP46100 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRXP46100 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRXP46100 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRXP46100 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
ATRXP46100 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRXP46100 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRXP46100 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRXP46100 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRXP46100 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRXP46100 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRXP46100 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
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