Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, human

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene	UniProt Accession	Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF1	P21675	AL589743.1-201	ENST00000551932	2712 nt	BASIC	0.85	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	Y_RNA.42-201	ENST00000362660	108 nt	BASIC	0.84	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	AC012668.1-201	ENST00000457625	228 nt	TSL 3 BASIC	0.84	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	ZNF654-201	ENST00000309495	4957 nt	APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC	0.84	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	SNORA63.5-201	ENST00000363548	123 nt	BASIC	0.84	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	AC244098.3-201	ENST00000424803	96 nt	BASIC	0.84	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	RNU7-48P-201	ENST00000458875	63 nt	BASIC	0.84	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	AC013244.2-201	ENST00000603396	103 nt	BASIC	0.84	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	Y_RNA.213-201	ENST00000364178	111 nt	BASIC	0.83	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	RNU6-1104P-201	ENST00000384723	104 nt	BASIC	0.83	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	RNU4-69P-201	ENST00000410677	143 nt	BASIC	0.83	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	AC096949.1-201	ENST00000412047	152 nt	BASIC	0.83	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	RNU6-1194P-201	ENST00000516208	104 nt	BASIC	0.83	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	RNU6-1061P-201	ENST00000516530	99 nt	BASIC	0.83	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	AC036111.3-201	ENST00000526389	112 nt	BASIC	0.83	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	AC090897.1-201	ENST00000580909	226 nt	BASIC	0.83	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	AC090616.3-202	ENST00000583346	205 nt	TSL 2 BASIC	0.83	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	RNY1P11-201	ENST00000363759	113 nt	BASIC	0.82	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	Y_RNA.563-201	ENST00000384707	108 nt	BASIC	0.82	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	RNU6-535P-201	ENST00000384722	107 nt	BASIC	0.82	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	AL603908.1-201	ENST00000406098	201 nt	BASIC	0.82	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	MIR1827-201	ENST00000408549	66 nt	BASIC	0.82	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	MIR1912-201	ENST00000410389	80 nt	BASIC	0.82	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	RNU6-62P-201	ENST00000516526	102 nt	BASIC	0.82	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	AC138749.4-201	ENST00000563970	127 nt	BASIC	0.82	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	MIR6841-201	ENST00000637129	72 nt	BASIC	0.82	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	Y_RNA.360-201	ENST00000365512	102 nt	BASIC	0.82	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	MIR508-201	ENST00000384857	115 nt	BASIC	0.82	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	AC002429.1-201	ENST00000437672	148 nt	BASIC	0.82	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	RNU6-1110P-201	ENST00000516462	101 nt	BASIC	0.82	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	AC019288.1-201	ENST00000557918	224 nt	BASIC	0.82	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	MIR4500-201	ENST00000579472	76 nt	BASIC	0.82	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	AL359881.1-201	ENST00000602916	267 nt	BASIC	0.82	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	AC243829.6-201	ENST00000612652	106 nt	BASIC	0.82	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	Y_RNA.198-201	ENST00000364013	98 nt	BASIC	0.81	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	RNU6-1117P-201	ENST00000384525	104 nt	BASIC	0.81	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	RNU6-429P-201	ENST00000384582	108 nt	BASIC	0.81	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	MIR518A1-201	ENST00000385068	85 nt	BASIC	0.81	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	MIR1257-201	ENST00000408490	117 nt	BASIC	0.81	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	MIR8087-201	ENST00000612745	78 nt	BASIC	0.81	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	AC132825.6-201	ENST00000638861	357 nt	BASIC	0.81	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	MIR30D-201	ENST00000362283	70 nt	BASIC	0.8	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	SNORD115-19-201	ENST00000363098	82 nt	BASIC	0.8	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	SNORD115-18-201	ENST00000363293	82 nt	BASIC	0.8	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	SNORD115-17-201	ENST00000364612	82 nt	BASIC	0.8	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	RNU6-1187P-201	ENST00000364771	110 nt	BASIC	0.8	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	SNORA19-201	ENST00000384737	128 nt	BASIC	0.8	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	RNU6ATAC6P-201	ENST00000408132	126 nt	BASIC	0.8	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	RNU2-51P-201	ENST00000410708	197 nt	BASIC	0.8	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	SUMO1P3-201	ENST00000439961	304 nt	BASIC	0.8	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	RNU7-156P-201	ENST00000517214	74 nt	BASIC	0.8	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	AC087741.2-201	ENST00000619415	172 nt	BASIC	0.8	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	RNA5SP133-201	ENST00000363368	119 nt	BASIC	0.8	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	RNY4P6-201	ENST00000363667	96 nt	BASIC	0.8	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	SNORA22-201	ENST00000383907	134 nt	BASIC	0.8	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	SNORA22C-201	ENST00000384614	134 nt	BASIC	0.8	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	MIR146A-201	ENST00000385201	99 nt	BASIC	0.8	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	MIR1263-201	ENST00000408324	86 nt	BASIC	0.8	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	AC092628.1-201	ENST00000436250	252 nt	BASIC	0.8	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	RNU6-94P-201	ENST00000607728	107 nt	BASIC	0.8	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	OMD-201	ENST00000375550	2449 nt	APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC	0.79	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	RNU6-403P-201	ENST00000363163	104 nt	BASIC	0.79	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	SNORD83.1-201	ENST00000411362	77 nt	BASIC	0.79	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	AC008267.6-201	ENST00000441664	139 nt	BASIC	0.79	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	RNU4-67P-201	ENST00000364569	141 nt	BASIC	0.78	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	SNORD58C-201	ENST00000365223	64 nt	BASIC	0.78	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	MIR605-201	ENST00000385078	83 nt	BASIC	0.78	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	Y_RNA.586-201	ENST00000391146	98 nt	BASIC	0.78	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	MIR548I2-201	ENST00000408348	149 nt	BASIC	0.78	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	PDCD5P2-201	ENST00000507570	312 nt	BASIC	0.78	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	AC141846.1-201	ENST00000568348	142 nt	BASIC	0.78	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	AC105081.1-201	ENST00000617727	106 nt	BASIC	0.78	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	AL162726.3-218	ENST00000636401	95 nt	BASIC	0.78	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	MTND5P18-201	ENST00000445624	1801 nt	BASIC	0.78	□□□□□ -2.28
TAF1	P21675	Y_RNA.344-201	ENST00000365381	112 nt	BASIC	0.78	□□□□□ -2.29
TAF1	P21675	RNU6-1081P-201	ENST00000384537	107 nt	BASIC	0.78	□□□□□ -2.29
TAF1	P21675	U8.15-201	ENST00000390947	134 nt	BASIC	0.78	□□□□□ -2.29
TAF1	P21675	MIR6866-201	ENST00000638146	69 nt	BASIC	0.78	□□□□□ -2.29
TAF1	P21675	ZNF518A-209	ENST00000614149	7911 nt	APPRIS P1 TSL 5 BASIC	0.77	□□□□□ -2.29
TAF1	P21675	MIRLET7F2-201	ENST00000385277	83 nt	BASIC	0.77	□□□□□ -2.29
TAF1	P21675	AC022523.2-201	ENST00000561045	150 nt	BASIC	0.77	□□□□□ -2.29
TAF1	P21675	MIR3163-201	ENST00000581592	73 nt	BASIC	0.77	□□□□□ -2.29
TAF1	P21675	RNA5SP347-201	ENST00000362445	119 nt	BASIC	0.76	□□□□□ -2.29
TAF1	P21675	Y_RNA.127-201	ENST00000363386	109 nt	BASIC	0.76	□□□□□ -2.29
TAF1	P21675	RNU6-1325P-201	ENST00000364905	105 nt	BASIC	0.76	□□□□□ -2.29
TAF1	P21675	RNU6-1335P-201	ENST00000365426	107 nt	BASIC	0.76	□□□□□ -2.29
TAF1	P21675	RPL39P34-201	ENST00000477141	156 nt	BASIC	0.76	□□□□□ -2.29
TAF1	P21675	AC002350.1-201	ENST00000490759	375 nt	BASIC	0.76	□□□□□ -2.29
TAF1	P21675	RNU6-781P-201	ENST00000516377	101 nt	BASIC	0.76	□□□□□ -2.29
TAF1	P21675	MIR6129-201	ENST00000616087	109 nt	BASIC	0.76	□□□□□ -2.29
TAF1	P21675	MIR2909-201	ENST00000617113	69 nt	BASIC	0.76	□□□□□ -2.29
TAF1	P21675	AL606753.1-201	ENST00000427435	87 nt	BASIC	0.75	□□□□□ -2.29
TAF1	P21675	RNU7-2P-201	ENST00000516096	62 nt	BASIC	0.75	□□□□□ -2.29
TAF1	P21675	RNA5SP476-201	ENST00000516613	103 nt	BASIC	0.75	□□□□□ -2.29
TAF1	P21675	AL136317.1-201	ENST00000612653	226 nt	BASIC	0.75	□□□□□ -2.29
TAF1	P21675	AC243829.3-201	ENST00000622177	108 nt	BASIC	0.75	□□□□□ -2.29
TAF1	P21675	MIR101-2-201	ENST00000362195	79 nt	BASIC	0.75	□□□□□ -2.29
TAF1	P21675	Y_RNA.536-201	ENST00000384621	113 nt	BASIC	0.75	□□□□□ -2.29
TAF1	P21675	MIR635-201	ENST00000384830	98 nt	BASIC	0.75	□□□□□ -2.29
TAF1	P21675	MIR100-201	ENST00000385259	80 nt	BASIC	0.75	□□□□□ -2.29

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