Protein–RNA interactions for Protein: O14493

CLDN4, Claudin-4, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4O14493 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN4O14493 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLDN4O14493 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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