Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR3

CDC42SE2, CDC42 small effector protein 2, humanhuman

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Length 84 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42SE2Q9NRR3 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-2.22□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-2.22□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC-2.24□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.25□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-2.26□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-2.26□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.26□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
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