Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.4 ms