Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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USP53Q70EK8 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
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USP53Q70EK8 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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USP53Q70EK8 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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USP53Q70EK8 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
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USP53Q70EK8 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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USP53Q70EK8 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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USP53Q70EK8 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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USP53Q70EK8 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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USP53Q70EK8 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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