Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USP49Q70CQ1 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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USP49Q70CQ1 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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USP49Q70CQ1 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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USP49Q70CQ1 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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USP49Q70CQ1 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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