Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATP6AP1Q15904 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATP6AP1Q15904 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATP6AP1Q15904 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATP6AP1Q15904 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATP6AP1Q15904 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATP6AP1Q15904 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATP6AP1Q15904 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATP6AP1Q15904 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATP6AP1Q15904 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATP6AP1Q15904 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATP6AP1Q15904 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATP6AP1Q15904 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATP6AP1Q15904 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATP6AP1Q15904 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATP6AP1Q15904 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATP6AP1Q15904 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATP6AP1Q15904 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATP6AP1Q15904 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATP6AP1Q15904 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATP6AP1Q15904 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATP6AP1Q15904 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.5 ms