Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
NEDD8Q15843 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
NEDD8Q15843 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
NEDD8Q15843 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
NEDD8Q15843 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
NEDD8Q15843 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
NEDD8Q15843 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
NEDD8Q15843 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
NEDD8Q15843 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
NEDD8Q15843 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
NEDD8Q15843 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
NEDD8Q15843 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
NEDD8Q15843 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
NEDD8Q15843 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
NEDD8Q15843 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
NEDD8Q15843 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
NEDD8Q15843 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
NEDD8Q15843 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
NEDD8Q15843 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
NEDD8Q15843 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
NEDD8Q15843 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
NEDD8Q15843 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
NEDD8Q15843 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
NEDD8Q15843 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
NEDD8Q15843 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
NEDD8Q15843 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
NEDD8Q15843 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.6□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
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