Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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SNX1Q13596 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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SNX1Q13596 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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SNX1Q13596 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
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SNX1Q13596 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNX1Q13596 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
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SNX1Q13596 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SNX1Q13596 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SNX1Q13596 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SNX1Q13596 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SNX1Q13596 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SNX1Q13596 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
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SNX1Q13596 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
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SNX1Q13596 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SNX1Q13596 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
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SNX1Q13596 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
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SNX1Q13596 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SNX1Q13596 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SNX1Q13596 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SNX1Q13596 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
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