Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
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TUBB3Q13509 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
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