Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-1.71□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-1.72□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-1.74□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.75□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-1.76□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TCOF1Q13428 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-1.79□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
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