Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC-2.41□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-2.42□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.42□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.43□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-2.46□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
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