Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
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CKAP4Q07065 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
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CKAP4Q07065 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CKAP4Q07065 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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