Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.46□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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