Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
VAX2Q9UIW0 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.4 ms