Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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CCDC88CQ9P219 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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CCDC88CQ9P219 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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CCDC88CQ9P219 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCDC88CQ9P219 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCDC88CQ9P219 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
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CCDC88CQ9P219 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCDC88CQ9P219 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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CCDC88CQ9P219 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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CCDC88CQ9P219 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCDC88CQ9P219 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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CCDC88CQ9P219 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCDC88CQ9P219 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCDC88CQ9P219 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCDC88CQ9P219 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCDC88CQ9P219 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCDC88CQ9P219 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCDC88CQ9P219 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCDC88CQ9P219 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCDC88CQ9P219 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCDC88CQ9P219 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCDC88CQ9P219 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCDC88CQ9P219 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCDC88CQ9P219 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCDC88CQ9P219 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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