Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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