Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
MEIS3Q99687 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MEIS3Q99687 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MEIS3Q99687 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MEIS3Q99687 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MEIS3Q99687 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MEIS3Q99687 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MEIS3Q99687 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MEIS3Q99687 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MEIS3Q99687 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MEIS3Q99687 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MEIS3Q99687 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MEIS3Q99687 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MEIS3Q99687 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MEIS3Q99687 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MEIS3Q99687 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MEIS3Q99687 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MEIS3Q99687 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MEIS3Q99687 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MEIS3Q99687 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MEIS3Q99687 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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MEIS3Q99687 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
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MEIS3Q99687 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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MEIS3Q99687 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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MEIS3Q99687 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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MEIS3Q99687 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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MEIS3Q99687 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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MEIS3Q99687 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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MEIS3Q99687 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MEIS3Q99687 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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