Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRPF18Q99633 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
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PRPF18Q99633 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PRPF18Q99633 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PRPF18Q99633 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PRPF18Q99633 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PRPF18Q99633 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
PRPF18Q99633 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
PRPF18Q99633 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PRPF18Q99633 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PRPF18Q99633 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PRPF18Q99633 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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PRPF18Q99633 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PRPF18Q99633 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
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PRPF18Q99633 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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PRPF18Q99633 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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PRPF18Q99633 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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PRPF18Q99633 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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PRPF18Q99633 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRPF18Q99633 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRPF18Q99633 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRPF18Q99633 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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PRPF18Q99633 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRPF18Q99633 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRPF18Q99633 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRPF18Q99633 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRPF18Q99633 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRPF18Q99633 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRPF18Q99633 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
PRPF18Q99633 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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