Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRNT1Q96Q11 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRNT1Q96Q11 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRNT1Q96Q11 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRNT1Q96Q11 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRNT1Q96Q11 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRNT1Q96Q11 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRNT1Q96Q11 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRNT1Q96Q11 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRNT1Q96Q11 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRNT1Q96Q11 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRNT1Q96Q11 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRNT1Q96Q11 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TRNT1Q96Q11 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TRNT1Q96Q11 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TRNT1Q96Q11 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TRNT1Q96Q11 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TRNT1Q96Q11 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TRNT1Q96Q11 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TRNT1Q96Q11 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TRNT1Q96Q11 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
TRNT1Q96Q11 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TRNT1Q96Q11 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TRNT1Q96Q11 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TRNT1Q96Q11 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TRNT1Q96Q11 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TRNT1Q96Q11 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
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