Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
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TOP1MTQ969P6 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
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TOP1MTQ969P6 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.84□□□□□ -2.54
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TOP1MTQ969P6 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
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TOP1MTQ969P6 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
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TOP1MTQ969P6 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
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TOP1MTQ969P6 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
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