Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLPPQ16740 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLPPQ16740 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLPPQ16740 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CLPPQ16740 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLPPQ16740 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLPPQ16740 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLPPQ16740 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLPPQ16740 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLPPQ16740 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLPPQ16740 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLPPQ16740 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLPPQ16740 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLPPQ16740 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLPPQ16740 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLPPQ16740 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLPPQ16740 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
CLPPQ16740 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLPPQ16740 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLPPQ16740 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLPPQ16740 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLPPQ16740 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
CLPPQ16740 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLPPQ16740 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLPPQ16740 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLPPQ16740 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLPPQ16740 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLPPQ16740 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
CLPPQ16740 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLPPQ16740 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLPPQ16740 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLPPQ16740 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLPPQ16740 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLPPQ16740 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLPPQ16740 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLPPQ16740 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLPPQ16740 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLPPQ16740 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLPPQ16740 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLPPQ16740 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLPPQ16740 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLPPQ16740 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLPPQ16740 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLPPQ16740 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLPPQ16740 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLPPQ16740 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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