Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.3 ms