Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CAPRIN1Q14444 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CAPRIN1Q14444 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CAPRIN1Q14444 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CAPRIN1Q14444 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CAPRIN1Q14444 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CAPRIN1Q14444 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CAPRIN1Q14444 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CAPRIN1Q14444 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CAPRIN1Q14444 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CAPRIN1Q14444 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CAPRIN1Q14444 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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