Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
C1DQ13901 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.91□□□□□ -2.56
C1DQ13901 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
C1DQ13901 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
C1DQ13901 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
C1DQ13901 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
C1DQ13901 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
C1DQ13901 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
C1DQ13901 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
C1DQ13901 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
C1DQ13901 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
C1DQ13901 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
C1DQ13901 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
C1DQ13901 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
C1DQ13901 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
C1DQ13901 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
C1DQ13901 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
C1DQ13901 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
C1DQ13901 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
C1DQ13901 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
C1DQ13901 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
C1DQ13901 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
C1DQ13901 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
C1DQ13901 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
C1DQ13901 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
C1DQ13901 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
C1DQ13901 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
C1DQ13901 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
C1DQ13901 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
C1DQ13901 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
C1DQ13901 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
C1DQ13901 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
C1DQ13901 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
C1DQ13901 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
C1DQ13901 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
C1DQ13901 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
C1DQ13901 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
C1DQ13901 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
C1DQ13901 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
C1DQ13901 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
C1DQ13901 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
C1DQ13901 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
C1DQ13901 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
C1DQ13901 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
C1DQ13901 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
C1DQ13901 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
C1DQ13901 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
C1DQ13901 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
C1DQ13901 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
C1DQ13901 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
C1DQ13901 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
C1DQ13901 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
C1DQ13901 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
C1DQ13901 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
C1DQ13901 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
C1DQ13901 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
C1DQ13901 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
C1DQ13901 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
C1DQ13901 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
C1DQ13901 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
C1DQ13901 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
C1DQ13901 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
C1DQ13901 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
C1DQ13901 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
C1DQ13901 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
C1DQ13901 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
C1DQ13901 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
C1DQ13901 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
C1DQ13901 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
C1DQ13901 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
C1DQ13901 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
C1DQ13901 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
C1DQ13901 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
C1DQ13901 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
C1DQ13901 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
C1DQ13901 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
C1DQ13901 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
C1DQ13901 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
C1DQ13901 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
C1DQ13901 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
C1DQ13901 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
C1DQ13901 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
C1DQ13901 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
C1DQ13901 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
C1DQ13901 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
C1DQ13901 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
C1DQ13901 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
C1DQ13901 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.99□□□□□ -2.57
C1DQ13901 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
C1DQ13901 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
C1DQ13901 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
C1DQ13901 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
C1DQ13901 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
C1DQ13901 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
C1DQ13901 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
C1DQ13901 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
C1DQ13901 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
C1DQ13901 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-1□□□□□ -2.57
C1DQ13901 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
C1DQ13901 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 311.3 ms