Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
RUNX3Q13761 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RUNX3Q13761 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RUNX3Q13761 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RUNX3Q13761 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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