Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ALCAMQ13740 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ALCAMQ13740 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ALCAMQ13740 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ALCAMQ13740 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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