Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NEUROD1Q13562 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NEUROD1Q13562 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NEUROD1Q13562 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NEUROD1Q13562 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NEUROD1Q13562 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NEUROD1Q13562 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NEUROD1Q13562 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NEUROD1Q13562 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NEUROD1Q13562 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NEUROD1Q13562 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NEUROD1Q13562 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NEUROD1Q13562 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NEUROD1Q13562 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NEUROD1Q13562 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NEUROD1Q13562 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NEUROD1Q13562 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
NEUROD1Q13562 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NEUROD1Q13562 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NEUROD1Q13562 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NEUROD1Q13562 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NEUROD1Q13562 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NEUROD1Q13562 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NEUROD1Q13562 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
NEUROD1Q13562 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms