Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ATRQ13535 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ATRQ13535 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ATRQ13535 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ATRQ13535 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ATRQ13535 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ATRQ13535 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATRQ13535 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATRQ13535 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATRQ13535 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATRQ13535 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATRQ13535 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATRQ13535 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATRQ13535 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATRQ13535 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATRQ13535 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATRQ13535 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATRQ13535 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATRQ13535 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATRQ13535 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATRQ13535 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATRQ13535 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATRQ13535 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATRQ13535 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATRQ13535 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATRQ13535 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATRQ13535 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATRQ13535 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATRQ13535 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATRQ13535 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATRQ13535 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATRQ13535 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATRQ13535 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATRQ13535 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATRQ13535 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATRQ13535 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATRQ13535 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATRQ13535 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATRQ13535 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATRQ13535 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATRQ13535 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATRQ13535 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATRQ13535 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATRQ13535 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATRQ13535 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATRQ13535 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATRQ13535 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATRQ13535 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATRQ13535 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATRQ13535 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATRQ13535 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATRQ13535 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATRQ13535 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATRQ13535 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATRQ13535 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATRQ13535 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATRQ13535 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATRQ13535 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATRQ13535 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATRQ13535 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATRQ13535 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATRQ13535 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATRQ13535 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATRQ13535 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATRQ13535 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATRQ13535 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ATRQ13535 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ATRQ13535 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ATRQ13535 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ATRQ13535 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ATRQ13535 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ATRQ13535 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ATRQ13535 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
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