Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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TUBB3Q13509 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TUBB3Q13509 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
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TUBB3Q13509 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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TUBB3Q13509 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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TUBB3Q13509 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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TUBB3Q13509 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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TUBB3Q13509 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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TUBB3Q13509 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TUBB3Q13509 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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