Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
MTA1Q13330 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MTA1Q13330 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MTA1Q13330 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MTA1Q13330 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
MTA1Q13330 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MTA1Q13330 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MTA1Q13330 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MTA1Q13330 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.3 ms