Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RIGQ13278 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RIGQ13278 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
RIGQ13278 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RIGQ13278 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RIGQ13278 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RIGQ13278 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RIGQ13278 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RIGQ13278 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RIGQ13278 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RIGQ13278 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RIGQ13278 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RIGQ13278 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RIGQ13278 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RIGQ13278 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RIGQ13278 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RIGQ13278 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RIGQ13278 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RIGQ13278 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RIGQ13278 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RIGQ13278 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RIGQ13278 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RIGQ13278 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RIGQ13278 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RIGQ13278 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
RIGQ13278 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RIGQ13278 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RIGQ13278 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RIGQ13278 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RIGQ13278 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
RIGQ13278 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RIGQ13278 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RIGQ13278 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RIGQ13278 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RIGQ13278 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RIGQ13278 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
RIGQ13278 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIGQ13278 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIGQ13278 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIGQ13278 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIGQ13278 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIGQ13278 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIGQ13278 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIGQ13278 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIGQ13278 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIGQ13278 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIGQ13278 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIGQ13278 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIGQ13278 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIGQ13278 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIGQ13278 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIGQ13278 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIGQ13278 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIGQ13278 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIGQ13278 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RIGQ13278 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIGQ13278 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIGQ13278 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIGQ13278 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIGQ13278 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIGQ13278 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
RIGQ13278 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIGQ13278 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIGQ13278 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIGQ13278 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIGQ13278 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIGQ13278 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIGQ13278 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIGQ13278 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIGQ13278 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RIGQ13278 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
RIGQ13278 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RIGQ13278 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms