Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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