Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPRDP23468 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
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