Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VPREB1P12018 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms