Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTIFO43310 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTIFO43310 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTIFO43310 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTIFO43310 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTIFO43310 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTIFO43310 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTIFO43310 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTIFO43310 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CTIFO43310 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CTIFO43310 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CTIFO43310 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CTIFO43310 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CTIFO43310 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CTIFO43310 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CTIFO43310 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CTIFO43310 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CTIFO43310 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CTIFO43310 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CTIFO43310 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CTIFO43310 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
CTIFO43310 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CTIFO43310 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CTIFO43310 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CTIFO43310 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CTIFO43310 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CTIFO43310 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CTIFO43310 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CTIFO43310 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CTIFO43310 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CTIFO43310 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CTIFO43310 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CTIFO43310 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CTIFO43310 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CTIFO43310 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CTIFO43310 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CTIFO43310 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CTIFO43310 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CTIFO43310 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CTIFO43310 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CTIFO43310 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CTIFO43310 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CTIFO43310 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTIFO43310 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTIFO43310 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTIFO43310 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTIFO43310 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTIFO43310 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CTIFO43310 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTIFO43310 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTIFO43310 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTIFO43310 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTIFO43310 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTIFO43310 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CTIFO43310 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CTIFO43310 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CTIFO43310 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CTIFO43310 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CTIFO43310 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CTIFO43310 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CTIFO43310 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CTIFO43310 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CTIFO43310 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CTIFO43310 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CTIFO43310 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CTIFO43310 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CTIFO43310 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CTIFO43310 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CTIFO43310 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CTIFO43310 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CTIFO43310 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CTIFO43310 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CTIFO43310 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CTIFO43310 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CTIFO43310 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CTIFO43310 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CTIFO43310 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CTIFO43310 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CTIFO43310 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CTIFO43310 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CTIFO43310 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CTIFO43310 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CTIFO43310 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CTIFO43310 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CTIFO43310 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CTIFO43310 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CTIFO43310 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CTIFO43310 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
CTIFO43310 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTIFO43310 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTIFO43310 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTIFO43310 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTIFO43310 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTIFO43310 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTIFO43310 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTIFO43310 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTIFO43310 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTIFO43310 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTIFO43310 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CTIFO43310 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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