Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
CRXO43186 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CRXO43186 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CRXO43186 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CRXO43186 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CRXO43186 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CRXO43186 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CRXO43186 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CRXO43186 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CRXO43186 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CRXO43186 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CRXO43186 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CRXO43186 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CRXO43186 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CRXO43186 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CRXO43186 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CRXO43186 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CRXO43186 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CRXO43186 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CRXO43186 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CRXO43186 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CRXO43186 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CRXO43186 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CRXO43186 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CRXO43186 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CRXO43186 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CRXO43186 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CRXO43186 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CRXO43186 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CRXO43186 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CRXO43186 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CRXO43186 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CRXO43186 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CRXO43186 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CRXO43186 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CRXO43186 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CRXO43186 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CRXO43186 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CRXO43186 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CRXO43186 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CRXO43186 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CRXO43186 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CRXO43186 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CRXO43186 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CRXO43186 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CRXO43186 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CRXO43186 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CRXO43186 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CRXO43186 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.87□□□□□ -2.55
CRXO43186 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CRXO43186 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CRXO43186 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
CRXO43186 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CRXO43186 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CRXO43186 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CRXO43186 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CRXO43186 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CRXO43186 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CRXO43186 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CRXO43186 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CRXO43186 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CRXO43186 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CRXO43186 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CRXO43186 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CRXO43186 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CRXO43186 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CRXO43186 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CRXO43186 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CRXO43186 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CRXO43186 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CRXO43186 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CRXO43186 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
CRXO43186 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CRXO43186 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CRXO43186 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CRXO43186 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CRXO43186 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
CRXO43186 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CRXO43186 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CRXO43186 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CRXO43186 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CRXO43186 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CRXO43186 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CRXO43186 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CRXO43186 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CRXO43186 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CRXO43186 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CRXO43186 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CRXO43186 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CRXO43186 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CRXO43186 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CRXO43186 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CRXO43186 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
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