Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms