Protein–RNA interactions for Protein: V9GXR0

H2-Bl, Histocompatibility 2, blastocyst, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-BlV9GXR0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-BlV9GXR0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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H2-BlV9GXR0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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H2-BlV9GXR0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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H2-BlV9GXR0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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H2-BlV9GXR0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-BlV9GXR0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms