Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms