Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcniQ9Z2V9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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